Profesorius Gediminas Vitkus VU TSPMI dėsto nuo 1992-ųjų metų. 1993-1995 metais VU TSPMI direktoriaus pavaduotojas studijoms. 1995-1998 metais Europos integracijos studijų centro direktorius. Lietuvos politologų asociacijos narys nuo 1991 metų, 2000-2001 metais - asociacijos prezidentas. Nuo 1998 metų Pilietinių iniciatyvų centro narys. Nuo 2001 metų Lietuvos karo akademijos Politikos mokslų katedros vedėjas. Nuo 2003 metų žurnalo “Lietuvos metinė strateginė apžvalga” atsakingasis redaktorius. Nuo 2011 metų Lietuvos mokslo tarybos Humanitarinių ir socialinių mokslų komiteto narys.